Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C1Q4G0N8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms