Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms