Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIDA1Q1XH10 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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