Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF1Q15637 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF1Q15637 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF1Q15637 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF1Q15637 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF1Q15637 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF1Q15637 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF1Q15637 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF1Q15637 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF1Q15637 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF1Q15637 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF1Q15637 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF1Q15637 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF1Q15637 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF1Q15637 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF1Q15637 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF1Q15637 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF1Q15637 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF1Q15637 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF1Q15637 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF1Q15637 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SF1Q15637 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF1Q15637 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF1Q15637 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SF1Q15637 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SF1Q15637 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SF1Q15637 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SF1Q15637 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF1Q15637 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF1Q15637 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SF1Q15637 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF1Q15637 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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