Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC41Q15345 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC41Q15345 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC41Q15345 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms