Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1I3Q14994 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1I3Q14994 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1I3Q14994 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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