Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3AQ14156 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3AQ14156 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms