Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA3CQ13748 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms