Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CACNA1SQ13698 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNA1SQ13698 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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