Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGA7Q13683 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA7Q13683 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA7Q13683 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms