Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1H3Q13133 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H3Q13133 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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