Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK3Q13003 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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