Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXF2Q12947 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF2Q12947 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF2Q12947 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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