Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTN1Q12860 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN1Q12860 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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