Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF5Q12774 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF5Q12774 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF5Q12774 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF5Q12774 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
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