Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CPSF1Q10570 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CPSF1Q10570 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
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