Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4CQ08493 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDE4CQ08493 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms