Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.817e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.877e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 419.87■□□□□ 0.777e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 ERGIC1-207ENST00000520326 647 ntTSL 518.68■□□□□ 0.587e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.337e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.147e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.017e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 511.01□□□□□ -0.657e-18■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 318.57■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 33.4
FMR1Q06787 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 33.4
FMR1Q06787 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.334e-8■■■■■ 33.4
FMR1Q06787 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 310.05□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 33.4
FMR1Q06787 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 33.4
FMR1Q06787 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 33.4
FMR1Q06787 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.62■□□□□ 0.099e-8■■■■■ 33.3
FMR1Q06787 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.089e-8■■■■■ 33.3
FMR1Q06787 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 212.84□□□□□ -0.359e-8■■■■■ 33.3
FMR1Q06787 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 33.3
FMR1Q06787 CLUH-209ENST00000574210 1243 ntTSL 1 (best)22.37■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 33.3
FMR1Q06787 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 33.2
FMR1Q06787 EIF4G1-211ENST00000422614 750 ntTSL 514.23□□□□□ -0.139e-12■■■■■ 33.2
FMR1Q06787 DDX54-208ENST00000551344 872 ntTSL 523.75■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-211ENST00000439154 1310 ntTSL 1 (best)21.14■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.579e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-202ENST00000340870 963 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-215ENST00000457277 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.119e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-217ENST00000461422 717 ntTSL 27.16□□□□□ -1.269e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-220ENST00000470178 516 ntTSL 27.16□□□□□ -1.269e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 CFLAR-219ENST00000462763 588 ntTSL 25.75□□□□□ -1.499e-7■■■■■ 33.1
FMR1Q06787 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 33
FMR1Q06787 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 33
FMR1Q06787 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 33
FMR1Q06787 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 338.13■■■■□ 3.693e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 CLEC3B-203ENST00000490386 708 ntTSL 336.75■■■■□ 3.473e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 GALNT10-210ENST00000521786 600 ntTSL 335.14■■■■□ 3.221e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.083e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.271e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABCD3-204ENST00000468860 661 ntTSL 322.79■■□□□ 1.243e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 POLG-208ENST00000530292 1326 ntTSL 521.81■■□□□ 1.083e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 33
FMR1Q06787 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 13e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 33
FMR1Q06787 GALNT10-208ENST00000520647 4359 ntTSL 220.48■□□□□ 0.871e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.831e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-216ENST00000511767 463 ntTSL 520.2■□□□□ 0.823e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-212ENST00000509333 743 ntTSL 220.2■□□□□ 0.823e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.793e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.551e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 417.97■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 517.32■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 516.64■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 216.56■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 415.79■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 LRP12-202ENST00000424843 4092 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 LRP12-205ENST00000520770 853 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-201ENST00000358855 4422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 GALNT10-209ENST00000521781 703 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-209ENST00000486727 1647 ntTSL 211.64□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 211.51□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.63e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-205ENST00000432670 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.74□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 CCT2-214ENST00000553169 758 ntTSL 210.22□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-229ENST00000545558 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 CCT2-206ENST00000548787 852 ntTSL 210.18□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 MFAP3-204ENST00000519325 944 ntTSL 39.44□□□□□ -0.91e-17■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 EXOSC7-202ENST00000459856 434 ntTSL 38.88□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.013e-9■■■■■ 33
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 64.1 ms