RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530292.2

POLG-208, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, humanhuman

TSL 5

Gene POLG, Length 1,326 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLG-208ENST00000530292 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.18■■■■■ 4.5
POLG-208ENST00000530292 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.16■■■■□ 3.7
POLG-208ENST00000530292 ABCC9O60706 1549 aa37.05■■■■□ 3.52
POLG-208ENST00000530292 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.12■■■■□ 3.37
POLG-208ENST00000530292 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
POLG-208ENST00000530292 NACADO15069 1562 aa35.85■■■■□ 3.33
POLG-208ENST00000530292 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.79■■■■□ 3.32
POLG-208ENST00000530292 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.74■■■■□ 3.31
POLG-208ENST00000530292 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.73■■■■□ 3.31
POLG-208ENST00000530292 SCRIBQ14160 1630 aa34.9■■■■□ 3.18
POLG-208ENST00000530292 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.84■■■■□ 3.17
POLG-208ENST00000530292 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.75■■■■□ 3.156e-6■■□□□ 12.8
POLG-208ENST00000530292 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.61■■■■□ 3.13
POLG-208ENST00000530292 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.43■■■■□ 3.1
POLG-208ENST00000530292 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
POLG-208ENST00000530292 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.63■■■□□ 2.97
POLG-208ENST00000530292 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.59■■■□□ 2.97
POLG-208ENST00000530292 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.48■■■□□ 2.95
POLG-208ENST00000530292 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
POLG-208ENST00000530292 SMARCA4P51532 1647 aa33.39■■■□□ 2.94
POLG-208ENST00000530292 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.27■■■□□ 2.92
POLG-208ENST00000530292 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.15■■■□□ 2.9
POLG-208ENST00000530292 SMARCA2P51531 1590 aa33.15■■■□□ 2.9
POLG-208ENST00000530292 NCAPD3P42695 1498 aa33.09■■■□□ 2.89
POLG-208ENST00000530292 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
POLG-208ENST00000530292 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.04■■■□□ 2.88
POLG-208ENST00000530292 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
POLG-208ENST00000530292 WIZO95785 1651 aa32.92■■■□□ 2.86
POLG-208ENST00000530292 HMGXB3Q12766 1538 aa32.91■■■□□ 2.86
POLG-208ENST00000530292 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
POLG-208ENST00000530292 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
POLG-208ENST00000530292 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.26■■■□□ 2.75
POLG-208ENST00000530292 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.18■■■□□ 2.74
POLG-208ENST00000530292 NESP48681 1621 aa32.14■■■□□ 2.74
POLG-208ENST00000530292 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.13■■■□□ 2.73
POLG-208ENST00000530292 CFTRP13569 1480 aa32.03■■■□□ 2.72
POLG-208ENST00000530292 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.99■■■□□ 2.71
POLG-208ENST00000530292 ERCC6Q03468 1493 aa31.96■■■□□ 2.71
POLG-208ENST00000530292 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.78■■■□□ 2.68
POLG-208ENST00000530292 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.72■■■□□ 2.67
POLG-208ENST00000530292 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.72■■■□□ 2.67
POLG-208ENST00000530292 PRDM2Q13029 1718 aa31.71■■■□□ 2.67
POLG-208ENST00000530292 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.57■■■□□ 2.65
POLG-208ENST00000530292 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
POLG-208ENST00000530292 CUX2O14529 1486 aa31.42■■■□□ 2.62
POLG-208ENST00000530292 WDR62O43379 1518 aa31.42■■■□□ 2.62
POLG-208ENST00000530292 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
POLG-208ENST00000530292 ABCC8Q09428 1581 aa31.38■■■□□ 2.61
POLG-208ENST00000530292 TOPBP1Q92547 1522 aa31.3■■■□□ 2.6
POLG-208ENST00000530292 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.28■■■□□ 2.6
POLG-208ENST00000530292 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
POLG-208ENST00000530292 CUX1P39880 1505 aa31.18■■■□□ 2.58
POLG-208ENST00000530292 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
POLG-208ENST00000530292 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.05■■■□□ 2.56
POLG-208ENST00000530292 IFT140Q96RY7 1462 aa31.03■■■□□ 2.56
POLG-208ENST00000530292 TOP2BQ02880 1626 aa31.02■■■□□ 2.56
POLG-208ENST00000530292 SYNJ1O43426 1573 aa31.02■■■□□ 2.56
POLG-208ENST00000530292 SOGA1O94964 1423 aa31.01■■■□□ 2.56
POLG-208ENST00000530292 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.99■■■□□ 2.55
POLG-208ENST00000530292 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.93■■■□□ 2.54
POLG-208ENST00000530292 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
POLG-208ENST00000530292 TRIM41Q8WV44 630 aa30.85■■■□□ 2.53
POLG-208ENST00000530292 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
POLG-208ENST00000530292 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
POLG-208ENST00000530292 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.76■■■□□ 2.52
POLG-208ENST00000530292 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.513e-13■■■■■ 30.5
POLG-208ENST00000530292 WDR97A6NE52 1622 aa30.69■■■□□ 2.5
POLG-208ENST00000530292 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
POLG-208ENST00000530292 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.65■■■□□ 2.5
POLG-208ENST00000530292 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.63■■■□□ 2.49
POLG-208ENST00000530292 GRIN2BQ13224 1484 aa30.57■■■□□ 2.48
POLG-208ENST00000530292 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.56■■■□□ 2.48
POLG-208ENST00000530292 KIF27Q86VH2 1401 aa30.55■■■□□ 2.48
POLG-208ENST00000530292 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.45■■■□□ 2.47
POLG-208ENST00000530292 PBRM1Q86U86 1689 aa30.44■■■□□ 2.46
POLG-208ENST00000530292 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
POLG-208ENST00000530292 FBLN2P98095 1184 aa30.41■■■□□ 2.46
POLG-208ENST00000530292 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.4■■■□□ 2.46
POLG-208ENST00000530292 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
POLG-208ENST00000530292 IGF1RP08069 1367 aa30.35■■■□□ 2.45
POLG-208ENST00000530292 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.31■■■□□ 2.44
POLG-208ENST00000530292 SYNJ2O15056 1496 aa30.31■■■□□ 2.44
POLG-208ENST00000530292 OSCARQ8IYS5 282 aa30.3■■■□□ 2.44
POLG-208ENST00000530292 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.3■■■□□ 2.44
POLG-208ENST00000530292 ADAMTS12P58397 1594 aa30.25■■■□□ 2.43
POLG-208ENST00000530292 EEA1Q15075 1411 aa30.22■■■□□ 2.43
POLG-208ENST00000530292 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.2■■■□□ 2.43
POLG-208ENST00000530292 CHD1O14646 1710 aa30.2■■■□□ 2.42
POLG-208ENST00000530292 CUL7Q14999 1698 aa30.19■■■□□ 2.42
POLG-208ENST00000530292 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
POLG-208ENST00000530292 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.18■■■□□ 2.42
POLG-208ENST00000530292 GRIN2AQ12879 1464 aa30.14■■■□□ 2.42
POLG-208ENST00000530292 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.04■■■□□ 2.4
POLG-208ENST00000530292 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.04■■■□□ 2.4
POLG-208ENST00000530292 PRXQ9BXM0 1461 aa29.99■■■□□ 2.39
POLG-208ENST00000530292 NUP160Q12769 1436 aa29.99■■■□□ 2.39
POLG-208ENST00000530292 CEP170Q5SW79 1584 aa29.94■■■□□ 2.38
POLG-208ENST00000530292 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.9■■■□□ 2.38
POLG-208ENST00000530292 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.83■■■□□ 2.37
POLG-208ENST00000530292 KIF21BO75037 1637 aa29.8■■■□□ 2.36
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