Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX8Q06710 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms