Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLCB3Q01970 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLCB3Q01970 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms