Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNC1Q01954 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNC1Q01954 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms