Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B2Q01814 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B2Q01814 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms