Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F1Q01094 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430 ms