Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTRA4P83105 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTRA4P83105 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA4P83105 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms