Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX3P78415 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX3P78415 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX3P78415 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX3P78415 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX3P78415 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX3P78415 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX3P78415 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX3P78415 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX3P78415 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX3P78415 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX3P78415 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX3P78415 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX3P78415 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX3P78415 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX3P78415 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX3P78415 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX3P78415 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX3P78415 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX3P78415 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX3P78415 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX3P78415 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX3P78415 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX3P78415 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX3P78415 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX3P78415 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX3P78415 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX3P78415 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX3P78415 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX3P78415 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX3P78415 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX3P78415 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX3P78415 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX3P78415 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX3P78415 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX3P78415 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX3P78415 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX3P78415 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX3P78415 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX3P78415 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX3P78415 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX3P78415 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX3P78415 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX3P78415 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX3P78415 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRX3P78415 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX3P78415 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX3P78415 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX3P78415 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX3P78415 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX3P78415 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX3P78415 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX3P78415 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX3P78415 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX3P78415 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX3P78415 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX3P78415 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX3P78415 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX3P78415 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX3P78415 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX3P78415 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX3P78415 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX3P78415 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX3P78415 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX3P78415 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX3P78415 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX3P78415 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms