Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA9P57773 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA9P57773 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA9P57773 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA9P57773 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA9P57773 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA9P57773 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA9P57773 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJA9P57773 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJA9P57773 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA9P57773 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA9P57773 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA9P57773 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA9P57773 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA9P57773 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA9P57773 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA9P57773 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA9P57773 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA9P57773 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA9P57773 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA9P57773 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA9P57773 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA9P57773 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA9P57773 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA9P57773 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA9P57773 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA9P57773 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA9P57773 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA9P57773 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA9P57773 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJA9P57773 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJA9P57773 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJA9P57773 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA9P57773 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA9P57773 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA9P57773 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA9P57773 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA9P57773 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA9P57773 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA9P57773 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA9P57773 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA9P57773 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA9P57773 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA9P57773 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA9P57773 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA9P57773 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA9P57773 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA9P57773 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA9P57773 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA9P57773 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GJA9P57773 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA9P57773 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA9P57773 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA9P57773 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA9P57773 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA9P57773 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA9P57773 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA9P57773 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA9P57773 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms