Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX16P57768 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX16P57768 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX16P57768 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX16P57768 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX16P57768 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX16P57768 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX16P57768 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX16P57768 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX16P57768 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX16P57768 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX16P57768 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX16P57768 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX16P57768 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX16P57768 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX16P57768 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX16P57768 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX16P57768 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX16P57768 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX16P57768 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX16P57768 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX16P57768 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX16P57768 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX16P57768 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX16P57768 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX16P57768 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX16P57768 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX16P57768 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX16P57768 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX16P57768 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX16P57768 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX16P57768 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX16P57768 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX16P57768 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX16P57768 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX16P57768 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX16P57768 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX16P57768 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX16P57768 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX16P57768 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX16P57768 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX16P57768 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX16P57768 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX16P57768 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX16P57768 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX16P57768 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX16P57768 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX16P57768 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX16P57768 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX16P57768 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX16P57768 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX16P57768 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX16P57768 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX16P57768 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX16P57768 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX16P57768 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX16P57768 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX16P57768 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX16P57768 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX16P57768 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX16P57768 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX16P57768 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX16P57768 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX16P57768 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms