Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP1P56715 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP1P56715 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP1P56715 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP1P56715 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP1P56715 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP1P56715 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RP1P56715 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP1P56715 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP1P56715 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP1P56715 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP1P56715 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP1P56715 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP1P56715 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP1P56715 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP1P56715 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP1P56715 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP1P56715 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP1P56715 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP1P56715 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP1P56715 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RP1P56715 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RP1P56715 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RP1P56715 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RP1P56715 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP1P56715 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP1P56715 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP1P56715 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP1P56715 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP1P56715 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP1P56715 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP1P56715 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP1P56715 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP1P56715 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP1P56715 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP1P56715 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RP1P56715 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RP1P56715 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RP1P56715 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RP1P56715 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RP1P56715 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP1P56715 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP1P56715 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RP1P56715 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RP1P56715 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP1P56715 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP1P56715 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP1P56715 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP1P56715 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP1P56715 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP1P56715 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP1P56715 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP1P56715 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP1P56715 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RP1P56715 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP1P56715 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms