Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB4P54760 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EPHB4P54760 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB4P54760 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms