Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP2S1P53680 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms