Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3M2P53677 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3M2P53677 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms