Protein–RNA interactions for Protein: P52757

CHN2, Beta-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN2P52757 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN2P52757 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN2P52757 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN2P52757 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN2P52757 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN2P52757 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN2P52757 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN2P52757 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN2P52757 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN2P52757 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN2P52757 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN2P52757 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN2P52757 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN2P52757 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN2P52757 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN2P52757 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN2P52757 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHN2P52757 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHN2P52757 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHN2P52757 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHN2P52757 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHN2P52757 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHN2P52757 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHN2P52757 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHN2P52757 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHN2P52757 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHN2P52757 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHN2P52757 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHN2P52757 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHN2P52757 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHN2P52757 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHN2P52757 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHN2P52757 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHN2P52757 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHN2P52757 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHN2P52757 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHN2P52757 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms