Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNA3P51805 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA3P51805 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms