Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KNTC1P50748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNTC1P50748 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms