Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBP50607 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBP50607 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBP50607 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBP50607 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBP50607 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBP50607 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBP50607 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBP50607 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBP50607 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBP50607 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBP50607 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBP50607 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBP50607 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBP50607 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBP50607 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBP50607 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBP50607 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBP50607 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBP50607 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBP50607 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBP50607 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBP50607 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBP50607 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBP50607 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBP50607 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBP50607 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBP50607 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBP50607 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBP50607 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBP50607 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBP50607 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBP50607 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBP50607 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBP50607 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBP50607 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBP50607 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBP50607 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBP50607 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBP50607 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBP50607 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBP50607 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBP50607 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBP50607 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBP50607 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBP50607 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBP50607 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBP50607 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBP50607 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBP50607 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBP50607 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBP50607 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBP50607 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBP50607 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBP50607 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms