Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER3P43115 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms