Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX2P40425 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX2P40425 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX2P40425 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX2P40425 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX2P40425 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX2P40425 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX2P40425 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX2P40425 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX2P40425 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX2P40425 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX2P40425 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX2P40425 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX2P40425 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX2P40425 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX2P40425 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX2P40425 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX2P40425 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX2P40425 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX2P40425 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX2P40425 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX2P40425 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX2P40425 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX2P40425 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX2P40425 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX2P40425 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX2P40425 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX2P40425 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX2P40425 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX2P40425 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX2P40425 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX2P40425 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX2P40425 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX2P40425 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX2P40425 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX2P40425 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX2P40425 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX2P40425 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PBX2P40425 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX2P40425 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX2P40425 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX2P40425 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX2P40425 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX2P40425 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX2P40425 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX2P40425 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX2P40425 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX2P40425 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX2P40425 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX2P40425 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms