Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD12P35452 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD12P35452 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD12P35452 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms