Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR1P25024 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms