Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F8A1P23610 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
F8A1P23610 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F8A1P23610 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
F8A1P23610 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F8A1P23610 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F8A1P23610 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F8A1P23610 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F8A1P23610 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F8A1P23610 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F8A1P23610 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F8A1P23610 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F8A1P23610 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
F8A1P23610 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8A1P23610 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8A1P23610 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8A1P23610 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8A1P23610 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F8A1P23610 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8A1P23610 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8A1P23610 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8A1P23610 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8A1P23610 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F8A1P23610 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F8A1P23610 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F8A1P23610 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8A1P23610 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8A1P23610 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8A1P23610 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8A1P23610 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F8A1P23610 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F8A1P23610 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
F8A1P23610 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
F8A1P23610 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F8A1P23610 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F8A1P23610 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8A1P23610 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8A1P23610 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F8A1P23610 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F8A1P23610 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F8A1P23610 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8A1P23610 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8A1P23610 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8A1P23610 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F8A1P23610 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F8A1P23610 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms