Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH3P22223 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH3P22223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDH3P22223 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH3P22223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH3P22223 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH3P22223 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH3P22223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH3P22223 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH3P22223 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH3P22223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH3P22223 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH3P22223 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH3P22223 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH3P22223 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH3P22223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH3P22223 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH3P22223 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH3P22223 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH3P22223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH3P22223 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH3P22223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH3P22223 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH3P22223 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH3P22223 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH3P22223 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH3P22223 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH3P22223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH3P22223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH3P22223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH3P22223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH3P22223 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH3P22223 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH3P22223 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH3P22223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms