Protein–RNA interactions for Protein: P20933

AGA, N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP20933 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP20933 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP20933 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP20933 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP20933 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP20933 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AGAP20933 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP20933 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP20933 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP20933 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP20933 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP20933 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP20933 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP20933 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP20933 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP20933 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP20933 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP20933 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP20933 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP20933 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP20933 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP20933 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP20933 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP20933 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP20933 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP20933 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP20933 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGAP20933 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGAP20933 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGAP20933 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGAP20933 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGAP20933 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AGAP20933 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AGAP20933 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AGAP20933 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AGAP20933 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGAP20933 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AGAP20933 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AGAP20933 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGAP20933 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AGAP20933 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AGAP20933 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AGAP20933 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AGAP20933 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms