Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNB1P20700 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB1P20700 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNB1P20700 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNB1P20700 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms