Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF3P17036 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF3P17036 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms