Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRF1P14222 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRF1P14222 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRF1P14222 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRF1P14222 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRF1P14222 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRF1P14222 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRF1P14222 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRF1P14222 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRF1P14222 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRF1P14222 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRF1P14222 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRF1P14222 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRF1P14222 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRF1P14222 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRF1P14222 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRF1P14222 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRF1P14222 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRF1P14222 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRF1P14222 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRF1P14222 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRF1P14222 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRF1P14222 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRF1P14222 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRF1P14222 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRF1P14222 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRF1P14222 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRF1P14222 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRF1P14222 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRF1P14222 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRF1P14222 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRF1P14222 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRF1P14222 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRF1P14222 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRF1P14222 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRF1P14222 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRF1P14222 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRF1P14222 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRF1P14222 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRF1P14222 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRF1P14222 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRF1P14222 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms