Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCP1P13796 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCP1P13796 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCP1P13796 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCP1P13796 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCP1P13796 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCP1P13796 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCP1P13796 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCP1P13796 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCP1P13796 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCP1P13796 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCP1P13796 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCP1P13796 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCP1P13796 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCP1P13796 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCP1P13796 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LCP1P13796 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LCP1P13796 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCP1P13796 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCP1P13796 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCP1P13796 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCP1P13796 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCP1P13796 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCP1P13796 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCP1P13796 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCP1P13796 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCP1P13796 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCP1P13796 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCP1P13796 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCP1P13796 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCP1P13796 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCP1P13796 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCP1P13796 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCP1P13796 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCP1P13796 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LCP1P13796 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LCP1P13796 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCP1P13796 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCP1P13796 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCP1P13796 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCP1P13796 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LCP1P13796 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCP1P13796 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCP1P13796 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms