Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNF35P13682 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF35P13682 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms