Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL5P13501 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL5P13501 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL5P13501 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL5P13501 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL5P13501 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL5P13501 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL5P13501 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL5P13501 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCL5P13501 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL5P13501 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL5P13501 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL5P13501 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL5P13501 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL5P13501 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL5P13501 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL5P13501 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL5P13501 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL5P13501 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL5P13501 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL5P13501 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL5P13501 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL5P13501 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL5P13501 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL5P13501 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCL5P13501 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCL5P13501 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCL5P13501 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCL5P13501 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL5P13501 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL5P13501 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL5P13501 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL5P13501 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCL5P13501 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL5P13501 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL5P13501 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL5P13501 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL5P13501 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL5P13501 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL5P13501 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL5P13501 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL5P13501 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL5P13501 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL5P13501 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL5P13501 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL5P13501 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL5P13501 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL5P13501 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCL5P13501 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCL5P13501 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL5P13501 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL5P13501 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL5P13501 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms