Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC5P13010 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC5P13010 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC5P13010 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC5P13010 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC5P13010 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC5P13010 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XRCC5P13010 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
XRCC5P13010 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.56■■■□□ 2
XRCC5P13010 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XRCC5P13010 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XRCC5P13010 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XRCC5P13010 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC5P13010 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
XRCC5P13010 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XRCC5P13010 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC5P13010 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC5P13010 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC5P13010 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC5P13010 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
XRCC5P13010 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XRCC5P13010 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRCC5P13010 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms